V sezóne 2006/2007 sa systém Corgoň ligy zmenil. Počet účastníkov sa rozšíril z desať na dvanásť. Po odohratí 22 kôl základnej časti sa súťaž rozdelí na dve skupiny nadstavbovej časti. Tímy od 1. do 8. miesta budú bojovať o titul a pohárové miestenky. Účastníci tejto skupiny si zo základnej časti súťaže prenesú výsledky zo vzájomných zápasov s mužstvami, s ktorými vytvorili nadstavbovú časť súťaže. Kluby, ktoré skončia po základnej časti na 9. – 12 mieste, vytvoria druhú osemčlennú skupinu, ktorú doplnia štyri najlepšie tímy z 1. ligy. Všetci účastníci tejto skupiny začnú nadstavbovú časť súťaže s nulovým bodovým ziskom. Prvé štyri mužstvá po ukončení tejto časti súťaže sa stanú účastníkmi nasledujúceho ročníka Corgoň ligy. Kluby umiestnené na 5. – 8. mieste tejto skupiny sa stanú účastníkmi nasledujúceho ročníka 1. ligy.
1. KOLO
Banská Bystrica – Žilina 2:1
Ružomberok – Trnava 4:0
Dubnica – Inter 5:2
Slovan – Trenčín 2:1
Košice – Artmedia 2:0
Senec – Nitra 0:1
2. KOLO
Nitra – Žilina 0:1
Trnava – Banská Bystrica 2:1
Inter – Ružomberok 2:1
Trenčín – Dubnica 0:1
Artmedia – Slovan 4:1
Senec – Košice 4:1
3. KOLO
Košice – Nitra 0:1
Slovan – Senec 2:0
Dubnica – Artmedia – odložené
Ružomberok – Trenčín 0:1
Banská Bystrica – Inter 0:0
Žilina – Trnava 1:0
4. KOLO, sobota 5. augusta o 17.00 h
Nitra – Trnava
Inter – Žilina
Trenčín – Banská Bystrica (20.00 hod.)
Artmedia – Ružomberok (6.8. o 10.30 h)
Senec – Dubnica (4.8. o 20.00 hod.)
Košice – Slovan (20.00 hod.)
5. KOLO, sobota 12. augusta o 20.00 H
Slovan – Nitra
Dubnica – Košice
Ružomberok – Senec
Žilina – Trenčín
B. Bystrica – Artmedia (13. 8. o 20.00 h)
Trnava – Inter (v Senci)
6. KOLO, sobota 19. augusta o 17.00 H
Nitra – Inter
Trenčín – Trnava (20.00 hod.)
Artmedia – Žilina (20. 8. o 10.30 hod.)
Senec – B. Bystrica (18. 8. o 20.00 h)
Košice – Ružomberok (20.00 hod.)
Slovan – Dubnica (20.00 hod.)
7. KOLO, sobota 26. augusta o 17.00 h
Dubnica – Nitra (20.00 hod.)
Ružomberok – Slovan (20.00 hod.)
Banská Bystrica – Košice (20.00 hod.)
Žilina – Senec (20.00 hod.)
Trnava – Artmedia (27. 8. o 20.00 hod.)
Inter – Trenčín
8. KOLO, utorok 29. augusta o 17.00 h
Nitra – Trenčín
Artmedia – Inter (30. 8.)
Senec – Trnava (30. 8. o 20.00 hod.)
Košice – Žilina (20.00 hod.)
Slovan – Banská Bystrica (20.00 hod.)
Ružomberok – Dubnica (20.00 hod.)
9. KOLO, sobota 9. septembra o 15.30 h
Ružomberok – Nitra (20.00 hod.)
Banská Bystrica – Dubnica
Žilina – Slovan (20.00 hod.)
Trnava – Košice (20.00 hod.)
Inter – Senec
Trenčín – Artmedia (20.00 hod.)
10. KOLO, sobota 16. septembra o 15.00 h
Nitra – Artmedia
Košice – Inter (20.00 hod.)
Slovan – Trnava
Senec – Trenčín (15. 9. o 20.00 hod.)
Dubnica – Žilina (20.00 hod.)
Ružomberok – Banská Bystrica (20.00 h)
11. KOLO, utorok 19. septembra 15.00 h
Artmedia – Senec
Inter – Slovan
Žilina – Ružomberok (20.00 hod.)
Trnava – Dubnica (20.00 hod.)
Trenčín – Košice (20.00 hod.)
Banská Bystrica – Nitra (20.00 hod.)
12. KOLO, sobota 23. septembra o 15.00 h
Nitra – Senec
Artmedia Košice (24. 9. o 10.30 hod.)
Trenčín – Slovan (20.00 hod.)
Inter – Dubnica
Trnava – Ružomberok (20.00 hod.)
Žilina – Banská Bystrica (20.00 hod.)
13. KOLO, sobota 30. septembra o 15.00 h
Košice – Senec (20.00 hod.)
Slovan – Artmedia
Dubnica – Trenčín (20.00 hod.)
Ružomberok – Inter (20.00 hod.)
Banská Bystrica – Trnava
Žilina – Nitra (20.00 hod.)
14. KOLO, utorok 3. októbra o 14.30 h
Trnava – Žilina (17.30 hod.)
Inter – Banská Bystrica
Trenčín – Ružomberok (17.30 hod.)
Artmedia – Dubnica
Senec – Slovan (17.30 hod.)
Nitra – Košice
15. KOLO, sobota 14. októbra o 14.30 h
Slovan – Košice
Dubnica – Senec (17.30 hod.)
Ružomberok – Artmedia
Banská Bystrica – Trenčín
Žilina – Inter (17.30 hod.)
Trnava – Nitra (17.30 hod.)
16. KOLO, utorok 17. októbra o 14.00 h
Inter – Trnava
Trenčín – Žilina (17.30 hod.)
Artmedia – Banská Bystrica
Senec – Ružomberok (17.30 hod.)
Košice – Dubnica (17.30 hod.)
Nitra – Slovan
17. KOLO, sobota 21. októbra o 14.00 h
Dubnica – Slovan (17.30 hod.)
Ružomberok – Košice
Banská Bystrica – Senec
Žilina – Artmedia (17.30 hod.)
Trnava – Trenčín (17.30 hod.)
Inter – Nitra
18. KOLO, sobota 28. októbra o 14.00 h
Trenčín – Inter
Artmedia – Trnava (29. 10. o 10.30 hod.)
Senec – Žilina (27. 10. o 17.30 hod.)
Košice – Banská Bystrica (17.30 hod.)
Slovan – Ružomberok
Nitra – Dubnica
19. KOLO, sobota 4. novembra o 13.30 h
Dubnica – Ružomberok (17.30 hod.)
Banská Bystrica – Slovan
Žilina – Košice (17.30 hod.)
Trnava – Senec (17.30 hod.)
Inter – Artmedia
Trenčín – Nitra
20. KOLO sobota 11. novembra o 13.30 h
Artmedia – Trenčín (12. 11. o 10.30 hod.)
Senec – Inter (10. 11. o 17.30 hod.)
Košice – Trnava
Slovan – Žilina
Dubnica – Banská Bystrica (17.30 hod.)
Nitra – Ružomberok
21. KOLO, sobota 18. novembra o 13.00 h
Banská Bystrica – Ružomberok
Žilina – Dubnica (17.30 hod.)
Trnava – Slovan (17.30 hod.)
Inter – Košice
Trenčín – Senec
Artmedia – Nitra (19. 11. o 10.30 hod.)
22. KOLO, sobota 25. novembra o 13.00 h
Nitra – Banská Bystrica
Ružomberok – Žilina
Dubnica – Trnava (17.30 hod.)
Slovan – Inter
Košice – Trenčín
Senec – Artmedia (24. 11. o 17.30 hod.)
